Другие изменения биоценоза вагинального биотопа выявляются при создании условий для реализации патогенных свойств грибов Candida, субъективно-асимптомное носительство которых в половых органах характерно для 15–20% небеременных женщин, при этом концентрация дрожжеподобных грибов во влагалище очень низкая. Известно, что в течение жизни 75% женщин имеют по меньшей мере один эпизод урогенитального кандидоза, при этом у части женщин отмечаются редкие рецидивы заболевания, которые связаны с такими провоцирующими факторами, как беременность, использование оральных контрацептивов с высоким содержанием эстрогенов, нарушение углеводного обмена, характер одежды, питание, гигиенические навыки.
Уменьшение количества или исчезновение эндогенной микрофлоры влагалища – Лактобактерий ведет к изменению рН вагинального секрета, что способствует прилипанию грибов Candida к эпителию влагалища, и развивается вульво-вагинальный кандидоз (молочница). Наиболее благоприятные условия для развития этого заболевания создаются при щелочной реакции вагинального секрета. Многими исследователями установлено участие дрожжеподобных грибов в различных вариантах инфекционного процесса: в 18,3% наблюдений грибы Candida размножались в составе полимикробных ассоциаций, характерных для БВ, что имеет важное практическое значение для выбора этиотропной терапии.